理工学専攻 博士前期課程は，産業基盤・社会基盤・数理情報・自然科学基盤の４教育基盤プログラムと特別プログラムから構成されます。
それぞれの教育基盤プログラムは，理工学研究科の複数の分野を包含し，学生はプログラムの提供するカリキュラムにおいて，自由度の高い学修・研究活動を行うことができるようになっています。
博士前期課程 自然科学基盤プログラムは，物理学・地球科学・化学・生物学とその複合分野から構成され，学生はそれぞれの専門分野の学修に加えて，自分が必要とする分野の科目を自律的に選択して学修し，俯瞰的視野や柔軟な適応力を養い，先端研究が要求する総合的スキルを修得することができます。
（旧）環境機能科学専攻 分子科学コース（〜2022）は，
【理工学専攻 自然科学基盤プログラム 化学分野】となっています。
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